ProtMMLM

ProtMMLM 是一个面向蛋白质发现的多模态基础模型框架，专为缺失模态场景下的肽类药物研发设计。它融合蛋白质序列、天然三维结构及分子动力学（MD）轨迹数据，通过联合预训练学习兼具结构感知与动力学感知的蛋白质表征；支持模态缺失鲁棒性建模、下游任务微调（如毒性预测、蛋白-蛋白相互作用识别）及物理性质探针分析（如总能量、RMSD一致性）。适用于计算生物学、AI驱动的肽类药物筛选、以及需整合动态构象信息的蛋白质功能预测场景。