OpenDDE

OpenDDE 是一个开源的全原子生物分子基础模型，专注于蛋白质-配体共折叠建模，支持药物发现中的结构预测、分子设计与优化。它基于深度学习架构，提供命令行接口和 Docker 镜像，支持 GPU/CUDA 与 CPU 两种运行模式，并内置模板检索与 RNA-MSA 预处理能力。项目处于预览阶段，适用于早期药物研发探索、学术研究及计算化学方法验证，暂不推荐用于临床或生产级管线。