xiaoyuanwang652-cmyk

cell-id-mapper

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癌细胞系 ID 跨数据库映射工具 (DepMap/COSMIC/Sanger)

AI 简介

cell-id-mapper 是一个用于癌细胞系标识符跨数据库映射的轻量级工具,支持 DepMap(ACH-xxx)、COSMIC/GDSC(纯数字)和 Sanger Cell Model Passports(SIDMxxxxxx)三大资源间的 ID 互查与转换。核心功能包括精确/模糊名称查找、多向 ID 类型转换(如 name↔DepMap↔COSMIC↔Sanger)、按癌种(lineage)或疾病(disease)筛选,以及覆盖率统计;基于内置2200+条标准化映射数据,纯 Python 实现,无外部依赖,命令行与 Python API 双接口。适用于癌症基因组学研究、药物敏感性分析、多源数据整合等需跨库比对细胞系的场景。

Python
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