pymol-claude-code

该项目通过Claude Code控制PyMOL，实现分子可视化操作。其核心功能是利用Model Context Protocol协议，将自然语言指令实时转换为PyMOL命令，支持结构获取、高亮活性位点残基、按二级结构着色及测量距离等功能，无需插件或图形界面交互。项目基于Python开发，适用于需要远程或本地进行复杂分子结构分析与展示的场景，如科研教育、药物设计等。用户只需在终端启动PyMOL，并通过简单的SSH反向隧道配置即可完成HPC集群上的远程控制设置。