PhenoPixel

PhenoPixel 是一个基于 Web 的细菌单细胞显微图像分析平台，支持 ND2 格式显微图像的自动化细胞分割、人工校正、多通道荧光与形态特征提取及批量表型统计。核心功能包括 ND2 文件管理、细胞轮廓提取、交互式标注、单细胞多视图（相位/荧光/热图/分布）查看，以及导出形状、荧光强度、轮廓和 Map256 等结构化数据。采用 FastAPI + React 架构，后端使用 SQLite 存储细胞级元数据，前端提供可视化探索界面。适用于微生物学、合成生物学等领域的细菌单细胞表型定量研究，尤其适配需兼顾自动化处理与人工复核的显微图像工作流。